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幾近完整高質量草莓參照基因組公布


夜夜騎視頻產業網 (2019年2月26日13:54)
幾近完整高質量草莓參照基因組公布
  據英國《自然·遺傳學》雜志25日在線發表的一項研究,美國科學家報告了一個幾近完整的草莓參照基因組。該高質量基因組不但為了解草莓起源和演化歷史提供了新見解,還對未來改善其品種及提高抗病性大有助力。

  八倍體栽培種草莓卡姆羅莎有8組染色體,也被稱為花園草莓,因其味美清香而深受喜愛。

  此次,美國密歇根州立大學研究人員帕德里克·艾德格及其同事,對該八倍體草莓的基因組進行了高質量組裝和注釋,共鑒定出10萬多個草莓基因。研究團隊對草莓屬二倍體種(擁有兩組染色體的草莓品種)的31組RNA分子進行了測序,并將二倍體種的表達基因序列與八倍體栽培種草莓的表達基因序列進行了對比。

  研究團隊隨后通過演化分析,鑒定出了森林草莓、飯沼草莓以及此前未知的綠色草莓和日本草莓,是八倍體栽培種草莓的4個二倍體祖先種。該分析結合現存種的地理分布還可以表明,八倍體草莓起源于北美。

  除此之外,團隊還對八倍體草莓的4個亞基因組開展了演化動力學分析,他們發現了一個占支配地位的亞基因組,能在很大程度上控制草莓的代謝和抗病性狀。

  研究人員總結表示,草莓的演化和起源信息、占主導地位的亞基因組,以及首個八倍體草莓高質量基因組,未來能作為研究人員和育種者改善栽培種花園草莓口味、香味和提高抗病性的有利資源。(記者張夢然)
采編:aimee 文章來源:科技日報     

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幾近完整高質量草莓參照基因組公布
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